Deze massage therapie heeft als uitgangspunt dat het lichaam is opgebouwd uit segmenten; ruggenmerg, ruggenmergzenuwen, organen, spieren, botten en huid. Alle onderdelen in een segment staan met elkaar in verbinding en kunnen elkaar zo beïnvloedden.
Segmentale massage therapie is gebaseerd op de werking van reflexzones en richt zich op herstel in het segment waar de klachten zich voordoen. Wanneer er bijvoorbeeld in één van de organen of spiergroep een afwijking/storing ontstaat zal dit na verloop van tijd invloed hebben op andere onderdelen in hetzelfde segment (reflex zone). Treed er bijvoorbeeld een storing op in de maag, dan zullen de spieren die door hetzelfde segment worden aangestuurd eveneens worden geprikkeld. Hierdoor ontstaat er een hogere spanning in de spieren. Houdt deze spanning te lang aan dan zullen er in de spieren stofwisseling problemen optreden met als gevolg spierpijn.
Omdat het zenuwstelsel werkt als een eenheid zullen storing en disbalans in deze structuur hun uiting op het lichaam tonen. Dit kan bijv. door verkleving en/of verkleuring van de huid. Echter overgevoeligheid van een bepaalde huidzone hoeft niet altijd te duiden op een orgaan probleem zoals boven omschreven.
Het zenuwstelsel en het hormoonstelsel werken als een samenhangend geheel. Als er in het zenuwstelsel overbelasting ontstaat door stress of spanning, kan het functioneren van spieren en organen eveneens verstoord worden. Bij de segmentale massage therapie wordt er geprobeerd om in het aangedane segment de balans te herstellen door behandeling van het gebied dat in verbinding staat met de klachten.
Een segmentale massage kan met Shiatsu therapie gecombineerd worden.